По территории Чарынского национального парка в пределах Алматинской области Республики Казахстан протекает река Чарын (Шарын) – приток реки Или, впадающий в нее слева. Протяженность реки Чарын составляет порядка 427 километров (по другим данным 255 км). В верхнем течении река известна как Шалкудысу, в среднем – Кегень. С поворота Кегеня на север водная артерия получает название Чарын. По ходу течения река принимает многочисленные притоки, наиболее значительным из которых является Темерлик (Железный). Одна из особенностей реки – преимущественно дождевое питание, наиболее полноводна она в период с мая по июнь. На реке построена Мойнакская ГЭС.

Долина Чарына в районе гор Кулуктау представляет собой каньон глубиной 400 метров. Крутые склоны каньона, колонны и арки тянутся к небу на 150-300 метров. Чарынский каньон — памятник природы, сложенный из осадочных пород, возраст которых составляет около 12 миллионов лет.

Эта наиболее полноводная река Северного Тянь-Шаня является туристическим объектом. В основном сюда приезжают любители водного туризма. Рафтинг по Чарыну – это серьезный рафтинг, очень активный и насыщенный.