Железнодорожная станция Шакубай расположена на административной территории села Шукубай Денисовского района Костанайской области Республики Казахстан. Принадлежит Акмолинскому отделению Казахстанских железных дорог и имеет код единой сетевой разметки под номером: 683704. Параллельно железнодорожного полотна пролегает асфальтированная автомобильная трасса А-22, соединяющая Северный и Западный Казахстан.

Село Шукубай входит в состав Тобольского сельского округа, и по данным переписи 2009 года в пристанционном населенном пункте проживают 98 человек (51 мужчина и 47 женщин). Станция Шакубай, 466,5 км, находится на железнодорожной линии Тобол - Джетыгара, между станциями Денисовка и Джетыгара.

В настоящее время станция Шакубай открыта для грузовых работ и здесь производятся все грузовые операции, предусмотренные параграфом, а также совершается посадка и высадка пассажиров на (из) поезда пригородного и местного сообщения.