Железнодорожная станция Койбагар расположена на административной территории одноименного села Карасуского района Костанайской области Республики Казахстан. Принадлежит Казахстанскому отделению Казахстанских железных дорог и имеет код единой сетевой разметки под номером: 682307.

Село Койбагар, расположенное в 52 км к юго-западу от районного центра поселка Карасу, является единственным населенным пунктом и административным центром Койбагарского сельского округа. По данным переписи 2009 года в селе проживают 1723 человека (843 мужчины и 880 женщин). Рядом с селом проходит автомобильная трасса, связывающая областной центр со столицей Республики Казахстан. Станция Койбагар, 325,7 км, находится на железнодорожной линии Тобол - Есиль, между станциями №75 и Кушмурун.

В настоящее время на станции Койбагор производится прием и выдача грузов повагонными и мелкими отправками, загружаемых целыми вагонами, только на подъездных путях и местах необщего пользования, а также совершаются все пассажирские операции, включая продажу билетов на все пассажирские поезда. Прием и выдача багажа не выполняется.